.gif)
مقدمة
برنامج PyMOL هو منصة متقدمة لتصوير وتحليل البُنى الجزيئية ثلاثية الأبعاد، ويُستخدم على نطاق واسع في مجالات الكيمياء الحيوية، البيولوجيا الجزيئية، وتصميم الأدوية. الإصدار الأخير 3.1.6.1، الذي صدر في يونيو 2025، يُعد نقلة نوعية في الأداء والوظائف، مما يجعله الخيار الأول للباحثين والمطورين في هذا المجال.
🧪 نبذة تاريخية
تم تطوير PyMOL في الأصل بواسطة Warren L. DeLano، وكان هدفه تمكين العلماء من الوصول إلى أدوات تصوير جزيئي مفتوحة المصدر. لاحقًا، تولت شركة Schrödinger صيانته وتطويره، مع الحفاظ على فلسفة المصدر المفتوح جزئيًا لدعم البحث العلمي.
💡 أبرز ميزات احدث الاصدارات (الإصدار 3.1.6.1)
| الميزة | الوصف |
|---|---|
| 🎥 RigiMOL | أداة لإنشاء تحولات بين البُنى الجزيئية، مثالية لصناعة أفلام علمية ثلاثية الأبعاد |
| 🖼️ Ray Tracing | تقنية عرض متقدمة توفر ظلال وانعكاسات واقعية |
| 🧭 واجهة محسّنة | تصميم بسيط وسهل الاستخدام حتى للمبتدئين |
| 📦 دعم تنسيقات متعددة | مثل PDB، SDF، وخرائط الكثافة الإلكترونية |
| 🧠 أدوات تحليل | قياس المسافات، الزوايا، التراكب البنيوي، والتفاعل بين الجزيئات |
| 🖨️ تصدير إلى VRML | للطباعة ثلاثية الأبعاد أو استخدام النماذج في تطبيقات الواقع الافتراضي |
🖥️ متطلبات التشغيل
- نظام التشغيل: Windows، macOS، Linux
- اللغات المدعومة: Python 3.10 أو 3.11
- مكتبات مساعدة: Numpy، PMW، OpenGL
🧭 الاستخدامات العلمية
- تصميم الأدوية وتحليل مواقع الارتباط
- دراسة البُنى ثلاثية الأبعاد للبروتينات والحمض النووي
- إنشاء عروض مرئية تفاعلية للتعليم
- تصدير النماذج للطباعة ثلاثية الأبعاد أو الواقع الافتراضي
📚 مصادر تعليمية
🔐 هل هو مجاني؟
يتوفر PyMOL بنسختين:
- نسخة مفتوحة المصدر: محدودة الميزات، مناسبة للاستخدام الأكاديمي
- نسخة Incentive: مدفوعة، توفر ميزات متقدمة ودعم فني
📥 روابط التحميل
برنامج PyMOL ليس مجرد أداة عرض جزيئي، بل هو منصة متكاملة للتحليل، التعليم،
والابتكار في العلوم الحيوية. ومع الإصدار 3.1.6.1، أصبح أكثر قوة ومرونة، مما
يجعله خيارًا مثاليًا لكل من الباحثين والمطور
وصف البرنامج
لم تعد دراسة ومعرفة جزئيات وذرات المواد المختلفة محتكرة على العلماء الذين
يمتلكون التجهيزات والأجهزة المكبرة ، فلقد اصبح هنالك الكثير من البرامج
الحاسوبية التي سهلت لنا الغوص في بحار العلوم ، وهذا احد هذه البرامج.
يقدم البرنامج خدمة محاكاة واقع الجزيئات والذرات المتناهية الصغر ، ويقدم
تطبيق وتصوير ثلاثي الأبعاد لذلك العالم الذي لا يرى بالعين المجردة.
يمكن استخدام البرنامج للتعرف على علم الكيمياء عن طريقة روية تراكيب جزئيات
المواد بشكل شبه واقعي كما يقدم العديد من الخصائص التي ستكتشفها انت بنفسك.
تحميل النسخة القديمة من البرنامج
اسم البرنامج : البرنامج الكيميائي PYMOL
الاصدار 1.5 لجميع انظمة التشغيل
ويندوز موقع البرنامج
http://www.pymol.org/ الحجم 14 ميغابايت.
Tags:
شروحات برامج